1、股权转让合同生效，尚未发生股权变动。即股权转让合同生效的时间与股权转让的生效时间是两个不同的概念。股权转让合同的生效，仅在转让方与受让方之间产生权利义务关系。合同生效，仅是股权变动的基础法律关系。在以合同方式转让股权的场合，合同的成立、生效与股权变动的生效是两种事实状态，表现为不同的法律关系。
2、股权转让协议的签订和"由股东以背书方式或法律、行政法规规定的其他方式转让"不是一回事，如果当事人之间仅仅签订合同，而未依公司法规定背书，双方仅仅成立了股权变动的基础法律关系，这一关系使得双方负担起变动某一法律关系的义务，但尚未使其变为现实。从法学理论上讲，这时的权利变动关系已经设定，但尚未开始处分。(民法学负担行为与处分行为理论)，所以没有处分行为，怎么可能发生股权的变动。这种情况下，当事人仅仅是一种股权变动的期待利益。
3、背书是最关键的，决定性的股东身份变更、股权变动的标志。做出这一结论基于两点：第一，从股票的性质，我们知道他是证权证券，背书后被背书人就是股票的所有人，《公司法》第126条规定，公司的股份采取股票的形式。股票是公司签发的证明股东所持股份的凭证。股票是证权证券。第二，从公司法法条陈述的语义逻辑和立法者的强调探求得知。《公司法》140条的特别规定："转让后由公司将受让人的姓名或名称及住所记载于股东名册。"，并且强调"后"，而不是"转让时"或"转让中"等等其他表意词，其主次分明。
如上所述，股权的变动不可能仅以一纸设定期待权的协议为标志来划分，合同行为仅是设定行为，它需要实实在在的处分行为。股权的转让类似于动产的转让关系，需以合同的签订和物的实际交付为变动效力的完成。那么怎么体现交付呢?对记名股票而言，为背书概莫能外。背书使得合同当事人之间的转让行为基本完成，在当事人之间无疑具有决定股权转让的效力。
如物权理论所言，物权行为是处分行为，在这里记名股票的背书行为即处分行为，背书交付是股权变动法律关系的基本完成，也是唯一的完成方式，4至此，类似于动产物权的公示公信力也基本产生。公司法规定背书即为转让的体现，可见如果合意达成，略去股权转让合同这一环节，背书即为合意行为的体现，背书完了，也完成了股权转让的主要法律关系，而且因为背书后受让人成为股票的持有人，所以股东身份有据可凭，其一定公示效力得以体现，所以不再是最狭隘的内部法律关系，在纯理论层面上，是有其公信力的。因为最起码了解受让人股东身份的其他第三人都不能否认其股东身份。我们必须承认股票是股东身份的法定凭证，只有这样才能正确理解为什么新公司法规定"转让后"，再由公司进行股东名册变更。注意这里用了一个"后"字，说明立法者认为股票的背书已经导致股权的转让了，在事实之"后"，所做的事情只能是对事实的完善，而不可能是对事实进行主体性的定性的关键的主要的环节了。
所以，当受让人合法正当的手持股票表明股东身份时，我们不能够因为我们的习惯和主观意愿，或某些一家之言而先入为主，睁着眼睛说瞎话，否定他的身份!既然不能睁着眼睛说瞎话，那作为新股东的受让人已经被验明正身了，又为什么不愿肯定股权已经发生了转移呢?那么，请尊重逻辑，尊重事实，那就是股权转让已生效。它的生效条件就是背书，只有这样的结论，从语言逻辑和事理逻辑两方面才是完全符合公司法的立法意旨的。
当然，往往在实践有些不合法的法外现象，比如公司没有发放股票，那么这怎么办呢?我认为这可以从协议来确定其内部的真实转让关系，因为转让人没有股票可供背书，所以只好取其次，签订协议以名心智，只要是真实的意思表示对法律关系的分析有益的，就应确认其效力，当然这里只能明确双方当事人之间的真实法律关系，如果涉及第三人，还要以其他法律要件为必要。其中，公司方有过错而致转让人遭受损失，转让人可以向公司追偿。
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