中星微电子有限公司知识产权部经理李东亚在接受中国知识产权报记者采访时表示，目前，传统的软件保护模式遇到了许多困难，主要在于两方面：一是著作权法保护的是作品的表达形式，而不保护内容本身。实际上，软件更重要的是软件所体现的思想，内容本身比软件的表达形式更为重要，而这恰恰是著作权法所不能进行保护的;二是著作权法认为程序等的“反向工程”是一种合理使用，而对软件进行“反向工程”则实际上损害了权利人的利益，打击了软件开发人的积极性，抑制了软件的创新发展。
北京宏远信通科技发展有限公司是一家高科技软件企业，公司总经理杨立新对知识产权报记者表示，著作权只能保护软件的源代码，只保护软件的表达形式，而不保护软件本身的创新思想和内容，对软件实行著作权登记只是一种备案。也就是说，只是一种证据的提前保全而已。
探寻软件著作权保护的新趋势
“著作权法保护模式下的软件保护的弊端，可在专利法中寻求解决。”杨立新建议，通过专利的形式可以提供直接的保护，可以保护软件本身的内容和思想，这样，对软件进行编译等“反向工程”在专利模式下则被认为是侵权行为，所以，用专利的形式来对软件进行保护，保护的强度显然更大，操作性更强。宏远信通公司就将Net800语音呼叫系统这项新技术申请了专利，这是一个融入了软件程序方法的产品专利申请。
据李东亚介绍，截至2005年，中星共申请了539项专利，PCT申请也达到了30多项。通过申请方法专利来保护软件占公司全部专利申请量的一半，另一半则是通过软硬件相结合的方式来保护软件的创新。
目前，对软件实行专利保护已经得到许多国家的认可。在美国，由于软件产业在其经济发展中占有重要地位，采用专利的手段来加强对软件的保护成为大势所趋。在日本，以专利形式来保护软件也逐渐被认可。日本特许厅曾公布过3种软件专利审查标准。近年来，日本软件专利的申请数显著增加，富士通、日本电气、日立、三菱、东芝、充电气等大公司成为该国软件专利申请的大户。
越来越多的案例和纠纷表明，国外许多发达国家和地区对软件保护已不再限于软件可否申请专利的讨论，而是更多关注软件专利的具体判断标准，即专利审查的第二道门槛——专利三性的问题。
“软件保护之路仍需开拓，我们要跟上发展潮流，进一步完善法律法规。”王瑜认为，对软件实行专利保护有利于建立起健康有序的软件发展环境。
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